議事録

2020-02-06

1 月以降の CIRCUS の改変

コードベースを全体的に TypeScript 化 (RS は元から TypeScript で記述している)
CI (Continuous Integration) を GitHub Actions ベースに（RS は未対応）
- サーバ側で自動テストを走らせる
設定ファイルの形式の統一（RS は未対応）
- Cosmiconfig を使った*.js ファイルベースの設定ファイル
- これまでは circus-cs-core が cosmiconfig、circus-rs が js を使った独自設定ファイル、circus-api が環境変数(.env)ベースになっており、複数個所に複数の形式で似たような設定をする必要があった
テストフレームワークを Mocha → Jest に（RS は未対応）
DICOM 画像（タグ情報）読み込みを JavaScript ベースに
- 理由：画像 1 枚ごとに Docker コンテナを起動するのは遅い
- TimeZoneOffset が指定されていない場合にデフォルト(例：+9 時間)を指定可能に
- エンコーディング周りの検証が不足している
ZIP ファイルからのインポートにちゃんと対応
- Docker を外したことで一時ファイルを作成せずに Zip からファイルを 1 つずつ取り出してインポート可能になった
自作の DI (Dependency Injection) コンテナを使ってコードを簡素化（RS は未対応）
circus-api の MongoDB の Aggregation Framework に対応（の途中）
- patientInfoCache と latestRevision が不要になる（予定）
- 基本動作については大丈夫そうだが速度周り、インデックスを貼った場合のふるまいについて要検証（データが 10 万件を超えたあたりである日突然急激に遅くならないか）
UI 側でも job 検索について Aggregation Framework 対応完了
scripts (migrate, import-series, etc.) にも自動化テストを適用

新 CIRCUS システムの現状確認

検索画面
- Series 検索
- Case 検索 (DB)
- Plug-in job search
  - 上記 3 つの検索は可能
- Plug-in job queue 画面が表示できない
  - 仕様検討段階 (セキュリティの観点から)
RS 関連 (以下をジェニュインに依頼する)
- ボリュームデータの表示に時間を要する
- 塗ったラベルが正しく表示されない (上/下端スライス)
- CS 結果画面 (脳動脈瘤検出) での VR 表示の正式対応 => 3 月末までに完成
ジョブ実行・プラグイン関係
- 重複処理防止機能
  - api は済 web-ui は未
- Series ruleset 機能の実装
- invalidate 機能の実装
  - 要；結果画面の管理者モード
- partialVolumeDescriptor 周り
  - dicom_voxel_dumper が DICOM tag の slice location (or image position) を　調べて頭 => 足に自動並べ替えを行っていることとの不整合
    - ジョブ実行時に circus-api 側で 2 枚の DICOM ファイルの tag を確認して　 partialVolumeDescriptor に記載する (dicom_voxel_dumper から自動並べ替え機能を外す)
dicom_utility の interactive モード実装
- dump までは行えるようになったが、従来の関数の一部変更などが必要なため来週までかかる見込み
(近い将来) 行うべきこと
- JavaScript 版 dicom_voxel_dumper の実装
  - Docker コンテナ (C++ アプリ) が 1 個不要になる

スケジュール管理について

Monorepo 化を行う (複数のパッケージを 1 つの git リポジトリにまとめて管理する)
CIRCUS ミーティングの議事録を Design Note に記入する